La estructura interna de ACUP se encuentra dividida en comisiones que son grupos de trabajo compuestos por socios y que tienen una afición común. Estas comisiones se encargan de organizar actividades durante el curso escolar así como reuniones internas en las que fomentan esa afición común.

Todos los socios pueden formar una comisión nueva, con objetivos y actividad diferentes a las ya formadas siempre y cuando estén compuestas por un número suficiente de personas. Te puedes informar en la propia asociación sobre las condiciones para formar una comisión.